מכון מופ"ת נוסד בשנת 1983 על-ידי האגף להכשרת עובדי הוראה במשרד החינוך. התפיסה שהנחתה את ייסודו הייתה כי למקצוע הכשרת המורים מאפייני ידע ייחודיים, וכי דרוש לו ביסוס מחקרי כמו גם מסגרות לימוד להתפתחות המקצועית של סגלי ההוראה. במהלך השנים נבנו במכון מסגרות פעילות מגוונות ללימוד, למחקר ולכתיבה.
המכון מעורב בתהליכים המתרחשים בהכשרת המורים ובמערכת החינוך, והוא מהווה מוסד המוביל עיון, דיון ומחקר בתחומים שהוא מתמחה בהם.
 
מסגרות הפעילות במכון
 
בית הספר ללימודי התמחות מקצועית ע"ש פרופ' משה זילברשטיין
בבית הספר ללימודי התמחות מקצועית פועלות תכניות בהיקפים שונים, אשר מטרתן להרחיב את הידע בתחומים ייחודיים להכשרת מורים כמו: הדרכה והנחיה, ניהול אקדמי, מחקר, הערכה ומדידה, טכנולוגיות מידע ותקשורת ואחרות.
מעת לעת נבנות בבית הספר תכניות ייחודיות הנענות לצרכים המתעוררים במערכת ההשכלה הגבוהה, במערכת הכשרת המורים ובמערכת החינוך.
מטרת הלימודים במסלולי ההתמחות בבית הספר היא לסייע בגיבוש הידע והתפיסה המקצועית ולרכוש כלים לעבודתה מושכלת.
במסגרת בית הספר ללימודי התמחות מקצועית פועלות הסדנאות שהן מסגרות קצרות טווח ללימוד ולהעשרה בתחומים הנוגעים להכשרת מורים ולתחומים המשיקים לה. 
 
ערוצי כתיבה
מגוון ערוצי הכתיבה במכון מופ"ת נועד לאפשר למורי המורים להפוך את הידע האישי לידע ציבורי, שיעמוד לרשות קהילת אנשי החינוך במכללות ובשדה.
השתתפות בתהליך הכתיבה ופרסום התוצרים הם נדבך רב-משמעות בהתפתחות המקצועית של הכותבים.

הוצאת הספרים
הוצאת הספרים של מכון מופ"ת מקבלת כתבי יד של כותבים מיומנים ומלווה צוותי כתיבה בצעדיהם הראשונים בתחום זה.
בהוצאה שלוש סדרות מרכזיות:
תמה (תיאוריה ומעשה בהכשרת מורים); כליל; ומונוגרפיות בחינוך
כתב העת האקדמי "דפים"
כתב העת האקדמי "דפים" הוא כתב עת שפיט המתמקד בהתפתחות מקצועית, בתיאוריה, במחקר ובפרקטיקה של הכשרת עובדי הוראה.
כתב העת "קיוונים"
כתב העת האקדמי "קיוונים" הוא כתב עת מקוון המהווה במה לכותבים שיש להם עניין להציג את מאמריהם תוך שימוש באמצעים טכנולוגיים חדשניים.
ביטאון מכון מופ"ת
ביטאון המכון הוא רבעון המהווה במה לשיח ולדיון בסוגיות בהכשרת המורים.
 
רשות המחקר
הרשות יוזמת ותומכת במחקרים אישיים ומערכתיים ומסייעת לחוקרים בדרכים מגוונות. היא פועלת בשני ערוצי פעולה מרכזיים: האחד, הרחבת בסיס הידע בתחום הכשרת המורים; האחר, קידום העשייה המחקרית של סגלי ההוראה במכללות ובמכון.
 
מפגשי עמיתים
מכון מופ"ת מקיים מסגרות שונות של מפגשי עמיתים: כנסים וימי עיון, מפגשים, פורומים וצוותי חשיבה, הרצאות מקוונות ועוד. במסגרות אלה עוסקים סגלי ההוראה במכללות ובמערכת החינוך בליבון נושאים משותפים, בדיון במחקרים שונים, בגיבוש עמדות בתחום הכשרת מורים ועוד.
 
שילוב טכנולוגיה בחינוך ובהוראה
מסגרת פעולה זו ממקדת את עיסוקה בהטמעת דרכי הוראה ולמידה העושות שימוש מושכל בטכנולוגיה מתקדמת לשיפור ההוראה.
 
הערוץ הבינלאומי
פעילות הערוץ הבינלאומי מכוונת להפיץ את הידע ואת הניסיון שנצבר במכון מופ"ת בארצות העולם ובתפוצה היהודית. הערוץ פועל בדרכים ישירות ומקוונות, בארץ ובעולם.
 
מרכז א.ד.מ. – אבני דרך במינהל מכללות
מרכז א.ד.מ. הוא בית ספר להכשרת עובדי מינהל במכללות. בית הספר מזמן ללומדיו קורסי בסיס וקורסים מתקדמים בתחומי מינהל. בית הספר נותן גם השתלמויות פנים-ארגוניות המכוונות לפיתוח ארגוני.
 
מערכות תומכות
מרכז תקשורת ופיתוח
מרכז התקשורת והפיתוח הבין-מכללתי מתמחה במתן שירותי טכנולוגיה למכללות להכשרת עובדי הוראה ולמוסדות חינוך מתוך התחשבות מירבית בצרכיה הייחודיים של מערכת החינוך. שירותיו כוללים פיתוח טכנולוגיות מתקדמות בהוראה ובלמידה מרחוק, ושירותי אינטרנט ותקשורת למגזר החינוך.
מרכז מידע
מרכז המידע מעמיד לרשות מורי המורים והחוקרים בתחום החינוך מאגרים של חומרים ומסמכים ייחודיים להכשרת המורים. במרכז הוקם פורטל תוכן - מס"ע (מופ"ת סובב עולם) בעברית ובאנגלית, שמצויים בו מאמרים ממוינים עדכניים בהכשרת מורים ובתחומים משיקים לה.